L'École française d'Extrême-Orient fait parte du réseau des cinq Écoles françaises à l'étranger :

Ces Écoles, fondées entre 1846 et 1928, relèvent du ministère de l'Enseignement supérieur et de la recherche et sont placées sous l'autorité scientifique de plusieurs Académies de l'Institut de France.

Depuis septembre 2016 les Écoles se sont dotées d'un site internet commun www.resefe.fr.