Conférence II: Phillip Endicott
27 MARS 23
Conférence NCKU-EFEO
Conférencier:
Dr. Phillip Endicott (Chercheur, Université de Tartu, Estonie/ Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris)
Sujet:
Joint quantitative analysis of genes and language using Contact Graphs applied to Papuan and Austronesian speaking communities of East Timor
Date:
Mercredi, 12 avril 2023 à 14h30
Lieu:
Salle 201, Institut d'archéologie, Campus Li-hsingUniversité nationale Cheng Kung, Tainan
Résumé:
Les récits de la préhistoire humaine sont confrontés à deux défis liés : assurer la falsification scientifique et intégrer différents aspects du passé dans une seule histoire. Parmi les sources de données possibles, le langage et les gènes offrent les meilleures perspectives de synthèse en raison de leurs processus historiques partagés, qui incluent l'héritage vertical et le transfert horizontal (c'est-à-dire le mélange en génétique et l'emprunt en linguistique). Cependant, la combinaison de deux ensembles de données différents augmente de manière super exponentielle le nombre d'arbres possibles et de nombreux modèles statistiques capables de tester des hypothèses pour la structure d'un ensemble de données s'avèrent avoir des fonctions de vraisemblance insolubles. Par conséquent, les études combinant des données génétiques et linguistiques sont généralement limitées à des comparaisons qualitatives pour l'indépendance entre les matrices récapitulatives basées sur la distance.Nous proposons un cadre où les langues et les gènes des mêmes populations sont analysés conjointement, contraints de partager une histoire, ou « contact », graphe décrivant les interactions entre leurs sociétés « porteuses » au sein d'un échafaudage partagé. Contrairement aux arbres phylogénétiques, les graphes de contact fournissent une topologie qui peut inclure des mélanges entre différentes familles de langues et plusieurs populations génétiques, pour modéliser des histoires locales détaillées. Bien que nous nous concentrions sur la diversité génétique et linguistique actuelle, l'approche peut faciliter l'inclusion de l'ADN humain ancien et des données archéologiques. Ceci fournit un premier pas vers un cadre statistique vers une analyse conjointe, afin d'avancer au-delà d'un récit narratif du passé et d'avoir des hypothèses statistiquement testables et, par conséquent, falsifiables.Notre région d'étude se situe à l'est de la ligne Wallace dans l'île d'Asie du Sud-Est, des Petites Sondes à la Papouasie occidentale. Dans cette étude pilote, nous examinons la zone de contact continu entre des modèles d'ascendances génétiques et linguistiques structurellement dissemblables au Timor oriental, où un changement/remplacement de langue généralisé s'est produit vers le papou et l'austronésien. Notre graphique de contact pour le Timor oriental, appris à l'aide d'un prototype de notre méthode proposée, est basé sur toutes les données (génétique : SNP et haplotypes ; linguistique : lexical et phonétique) pour cinq austronésiens (Kemak, Mambae, Tetun, Tokodede, Waima'a ) et trois communautés de langue papoue (Bunak, Fataluku, Makasae). Nous décrivons les proportions de transfert déduites pour le nombre minimum d'événements de contact requis pour expliquer la différence entre la structure prédite, compte tenu du graphique, et celle des données réelles.
La conférence sera présidée par le professeur CHAO Chin-yung, directeur de l'Institut d'archéologie, Université nationale Cheng Kung et le professeur Frank MUYARD, directeur du centre EFEO Taipei
La conférence sera donnée en anglais. Entrée libre.
conférence
Conférencier:
Dr. Phillip Endicott (Chercheur, Université de Tartu, Estonie/ Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris)
Sujet:
Joint quantitative analysis of genes and language using Contact Graphs applied to Papuan and Austronesian speaking communities of East Timor
Date:
Mercredi, 12 avril 2023 à 14h30
Lieu:
Salle 201, Institut d'archéologie, Campus Li-hsingUniversité nationale Cheng Kung, Tainan
Résumé:
Les récits de la préhistoire humaine sont confrontés à deux défis liés : assurer la falsification scientifique et intégrer différents aspects du passé dans une seule histoire. Parmi les sources de données possibles, le langage et les gènes offrent les meilleures perspectives de synthèse en raison de leurs processus historiques partagés, qui incluent l'héritage vertical et le transfert horizontal (c'est-à-dire le mélange en génétique et l'emprunt en linguistique). Cependant, la combinaison de deux ensembles de données différents augmente de manière super exponentielle le nombre d'arbres possibles et de nombreux modèles statistiques capables de tester des hypothèses pour la structure d'un ensemble de données s'avèrent avoir des fonctions de vraisemblance insolubles. Par conséquent, les études combinant des données génétiques et linguistiques sont généralement limitées à des comparaisons qualitatives pour l'indépendance entre les matrices récapitulatives basées sur la distance.Nous proposons un cadre où les langues et les gènes des mêmes populations sont analysés conjointement, contraints de partager une histoire, ou « contact », graphe décrivant les interactions entre leurs sociétés « porteuses » au sein d'un échafaudage partagé. Contrairement aux arbres phylogénétiques, les graphes de contact fournissent une topologie qui peut inclure des mélanges entre différentes familles de langues et plusieurs populations génétiques, pour modéliser des histoires locales détaillées. Bien que nous nous concentrions sur la diversité génétique et linguistique actuelle, l'approche peut faciliter l'inclusion de l'ADN humain ancien et des données archéologiques. Ceci fournit un premier pas vers un cadre statistique vers une analyse conjointe, afin d'avancer au-delà d'un récit narratif du passé et d'avoir des hypothèses statistiquement testables et, par conséquent, falsifiables.Notre région d'étude se situe à l'est de la ligne Wallace dans l'île d'Asie du Sud-Est, des Petites Sondes à la Papouasie occidentale. Dans cette étude pilote, nous examinons la zone de contact continu entre des modèles d'ascendances génétiques et linguistiques structurellement dissemblables au Timor oriental, où un changement/remplacement de langue généralisé s'est produit vers le papou et l'austronésien. Notre graphique de contact pour le Timor oriental, appris à l'aide d'un prototype de notre méthode proposée, est basé sur toutes les données (génétique : SNP et haplotypes ; linguistique : lexical et phonétique) pour cinq austronésiens (Kemak, Mambae, Tetun, Tokodede, Waima'a ) et trois communautés de langue papoue (Bunak, Fataluku, Makasae). Nous décrivons les proportions de transfert déduites pour le nombre minimum d'événements de contact requis pour expliquer la différence entre la structure prédite, compte tenu du graphique, et celle des données réelles.
La conférence sera présidée par le professeur CHAO Chin-yung, directeur de l'Institut d'archéologie, Université nationale Cheng Kung et le professeur Frank MUYARD, directeur du centre EFEO Taipei
La conférence sera donnée en anglais. Entrée libre.
conférence